Pegatinas para la nave: Si tienes partidas salvadas de los siguientes juegos, podrás decorar con pegatinas la nave de Samus:
Wii Play
Wii Sports
Zelda: Twilight Princess
Super Paper Mario
Metroid Prime 3
Excite Truck
Wario Ware: Smooth Moves
Mario Party 8
Modo de dificultad extra: Termina el juego en cualquier nivel de dificultad estándar.
Final extendido: Para ver el final extendido, consigue al menos el 75% de los objetos.
Final completo: Para ver el final completo, consigue el 100% de los objetos.
Mensaje secreto de Satoru Iwata:: En la nave de Samus, activa la radio y presiona los símbolos (de izquierda a derecha): segundo, séptimo, quinto, primero. El presidente de Nintendo te dará un mensaje de agradecimiento en japónes.
Mensaje secreto de Kenji Yamamoto:: En la nave de Samus, activa la radio y presiona los símbolos (de izquierda a derecha): tercero, sexto, cuarto, octavo. El compositor del juego te dará un mensaje de agradecimiento en japónes.
Mensaje secreto de Kensuke Tanabe:: En la nave de Samus, activa la radio y presiona los símbolos (de izquierda a derecha): primero, tercero, octavo, quinto. El productor te dará un mensaje de agradecimiento en japónes.
Mensaje secreto de Shigeru Miyamoto:: En la nave de Samus, activa la radio y presiona los símbolos (de izquierda a derecha): octavo, tercero, quinto, cuarto. Shigeru Miyamoto te dará un mensaje de agradecimiento en japónes.
Mensaje secreto de Yoshio Sakamoto:: En la nave de Samus, activa la radio y presiona los símbolos (de izquierda a derecha): cuarto, sexto, primero, séptimo. El co-creador de Metroid, junto a Gunpei Yokoi, te dará un mensaje de agradecimiento en japónes.
Conocer la localización de los objetos: En Skytown, al ir a conseguir la primera parte de la bomba, usa la nave y busca Phazite. Dispara al interruptor que hay dentro para activar el sistema de satélites. Luego, sube por las paredes usando la spiderball y activa los interruptores con bombas. Activarás el sistema de satélites de manera definitiva y te indicará dónde están todos los objetos del juego, salvo en la nave Valhalla y la zona helada de Bryyo.